O Logotipo representa a Identidade, a Cultura, a História e a Imagem da Escola Superior de Enfermagem S. Francisco das Misericórdias. É constituído por:

• TAU - Uma das formas de reprodução da cruz chamada "Comissa" e representa uma das letras do alfabeto grego e hebraico. São Francisco utilizou-a como sinal da salvação, meio de cura, e ainda como assinatura e escudo de armas dos frades menores.
• Camaroeiro - É o ex-líbris adoptado pela rainha D. Leonor e o que convencionalmente melhor a representa para além das armas pessoais.
• Estrela de Sete Pontas - As sete obras de misericórdia espirituais.
• Rosa de Sete Pétalas - As sete obras de misericórdia temporais.